La région de Franche-Comté est divisée en 4 départements : le Doubs, la Haute-Saône, le Jura et le Territoire de Belfort.
La Franche-Comté est une région relativement montagneuse que l'on peut considérer comme encerclée par des massifs.
On y trouve notamment la chaîne de montagnes du Jura, bordant la Suisse.Au nord de la région se trouvent les Vosges et enfin plus au sud, les Alpes.